Die Qualitätspolitik der WITENO GmbH ist darauf ausgerichtet,  ihren Kunden ein qualitativ hochwertiges Produkt- und Servicepaket zur Verfügung zu stellen. Dazu zählt die Infrastruktur genauso wie die infrastrukturnahen Dienstleistungen und die Beratung.

Das Qualitätsmanagement-System wurde bereits 2005 im Zuge von Kundenanfragen im BioTechnikum Greifswald eingeführt. Es hat sich insbesondere für Unternehmen bewährt, die ihre Prozesse lückenlos dokumentieren müssen wie bspw. in der Medizintechnik oder Pharmaindustrie. Darüber hinaus ermöglicht der Auditierungsprozess  der WITENO, die Qualität der eigenen Produkte und Prozesse an Qualitätsmaßstäben zu messen. Für bestehende und potentielle Kunden ist das Qualitätszertifikat damit Ausweis der Leistungsfähigkeit der Gesellschaft. Schließlich hat sich das QM-System als originäres Management-System im Hinblick auf die Harmonisierung und Standardisierung von Abläufen an verschiedenen Standorten als nützlich erwiesen.

Im Jahr 2017 wurde das QM-System auf die neue Norm DIN ISO 9001:2015 umgestellt und in einem erneuten Zertifizierungsaudit über das BioTechnikum Greifswald hinaus das Technologiezentrum Vorpommern und das cowork Greifswald erfolgreich eingebunden.

Der WITENO GmbH ist auch Verantwortung in der öffentlichen Kommunikation besonders wichtig, weshalb die Berücksichtigung von gesellschaftlichen Grundwerten und moralischen Vorstellung absolut selbstverständlich ist. Aus diesem Grund wird der Verhaltenskodex des Leitfadens des Deutschen Werberates stets beachtet und umgesetzt.